Останутся до следующего запуска. Когда из БД будут выгружаться новые версии, то оставшиеся "недобитыми" dll перезапишуться...
А вообще конечно надо менять способ снхронизации на менее гемморойный

Сейчас этот форум просматривают: AhrefsBot, Google-бот и гости: 12